根據起因不同，木材顏色會有兩種，一種是化學變色，包括鞣質變色和氧化變色，以及木材的化學變色：木材在很多種情況下都有變化。它的水分含量越高，或者長期暴露在潮濕空氣中就會發生變色，這不是由木材的真菌感染所致，而是由木材中的某些成分發生化學反應所致，這就叫化學變色，化學變色的特點是顏色深淺，顏色更均勻一致。
熏蒸實木木箱原木鋸材和已制成的出口木箱均有變色危險。伐木后，原木端頭和不完整樹皮下易發生變色。木材加工后，鋸材(板材、方材)在貯存、加工過程中，還會發生青變、褐變、霉變等。
木制單寧、色素、生物堿、糖、酚等有機化合物的氧化縮合反應，其中以酚類物質的氧化為主。酚具有苯環結構，容易被氧化，這是造成化學變色的原因。苯酚在被氧化之前是無色的，有一些是可以溶解的，氧化產生不溶于水的縮合物，顏色是紅色，紅棕色，棕色，所以化學變色也叫做氧化變色。
有些木料含有丹寧酸，也稱植物鞣質，是多元酚類化合物，它與鐵接觸時，在潮濕的環境下，丹寧會與鐵發生化學反應(絡合反應)，形成丹寧酸。丹寧酸呈黑色，是制造墨水的主要原料，因而有可能使木材顏色變深。木料的顏色會由鐵的含量及木材與鐵的接觸時間而呈現出淡灰色到藍黑色。
如果把木材浸泡在含鐵水中，木料就會發生化學反應。此外，木材與銅或銅臺金接觸時，還會產生鞣酸銅，這是因為木材中的單寧酸銅還會導致木材變色(淡紅色)。木料的干燥過程中，化學變色也經常發生。很大的原因是木材干燥速度慢，特別是與墊木接觸的部位。對出口木箱用于危險貨物運輸的分級標準十分嚴格，不允許發生木材轉化。
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